がんメディカルインフォマティクス講座(国立がん研究センター東病院) 2020年度の学生募集をします

准教授: 山下 理宇(Riu Yamashita)
TEL:04-7134-8786
E-mail: riuyamas{at}east.ncc.go.jp
研究室HP

研究紹介

【キーワード】バイオインフォマティクス、転写制御、翻訳制御、マイクロバイオーム、多層オミクス解析、がんゲノム

 がんの治療開発を進めるためには、臨床試験などで得られる質の担保された臨床情報が必要です。これに加えて、そのメカニズムや薬の効果を調べるためには、患者検体や動物・細胞モデル試料を用いたゲノム、トランスクリプトームなどの多層オミクス解析のデータを欠かすこともできません。また、ヒトに存在する細菌を網羅的に調べたマイクロバイオーム情報も蓄積してきており、がんとの関連が着目されています。そして、このような解析技術が生み出すデータ量は日に日に多くなってきました。これらを統合して新知識を導き出すことは、既存の医学・生物学の知識だけではなく、どうやってデータを整理するのか・そのデータからどのように情報を抽出するのかといったバイオインフォマティクスと呼ばれる情報科学的な知識が不可欠です。現在、特にnon-coding RNA, マイクロバイオーム、がんゲノム等に対して、効率の良いデータ処理のパイプラインを設計するだけでなく、データを見やすくまとめたデータベースとしてのウェブサーバの構築、状況に応じて情報抽出方法を最適化する技術などを用いて医学・生物学の有益な情報を抽出しようとしています。がんメディカルインフォマティクス講座は、国立がん研究センターに集積する貴重な臨床多層オミクスデータを最大限活用し、医学・生物学・情報学を組み合わせることで、がん研究に貢献する「トランスレーショナルインフォマティクス」による新たな発見を目指しています。

研究室紹介

東京大学
東京大学大学院新領域創成科学研究科
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