大規模オーミクス解析分野

教授: 森下 真一
E-mail: moris{at}edu.k.u-tokyo.ac.jp
研究室HP

研究紹介

【キーワード】DNA オーミクス 1分子・1細胞計測 アルゴリズム 並列計算 機械学習

DNAとオーミクス周辺の生命科学の研究課題に取り組んでいます。生命科学は、情報学・数学・1分子計測技術の魅力的な実験場です。これらの学問を積極的に取り入れています。

DNAとオーミクス周辺の生命科学の研究課題

現在の研究中の課題を以下に挙げます。

情報学・数学からのアプローチ

これまでに応用を試した例を挙げます。

生命科学で新しい結果が出た場合は科学系の雑誌に報告し、生命科学で利用してほしいときにはバイオインフォマティクス系の雑誌(Bioinformatics 等)、コンピュータ・サイエンスとして価値がある場合には ACM, IEEE 等の雑誌に報告してきました。

これまでに論文発表した研究テーマ

大学院生の研究テーマ選び

自分が興味をもった研究でないと長続きしません。研究課題の選択は各自に委ねています。ただ新しい課題でないと困るし、インパクトもほしいので、そのあたりを研究室全体で議論します。学内の研究室、東大病院、スタンフォード大学、ワシントン大学、マックス・プランク研究所等の海外の研究機関と共同研究してます。国際会議に参加し、オンライン会議に参加し、共同研究先に訪問・滞在し、実践的な英語力を高めています。


図1 転写開始点下流のヌクレオソーム構造は遺伝的多様性に影響する
(出典 Sasaki et al. Science 2009)


図2 DNA折り畳み基礎構造ループは原腸陥入で確立する
(出典 Nakamura et al. Genome Res. 2021)

研究室紹介

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